Sex månader har passerat sedan ockupationen av Öland. För att svetsa samman en splittrad organisation samlas SNG på Åland, men när de ska åka hem igen förvandlas färjeterminalen till ett inferno. Byggnader exploderar, människor flyr i panik och SNG kastas rakt in i ett koordinerat bombattentat.
Samtidigt tar Sveriges statsminister emot den litauiske premiärministern på Harpsund. De diplomatiska förbindelserna mellan länderna har varit ansträngda sedan Öland ockuperades av en paramilitär litauisk grupp. Det informella besöket har som syfte att tina upp relationerna, men ingenting går enligt plan när gruppen bakom attacken mot Öland plötsligt är tillbaka.
KODNAMN HARPSUND är den tolfte delen i serien om Sjukvårdens nationella insatsgrupp (SNG). Återigen får vi följa de udda karaktärerna som leds av den erfarne traumakirurgen KG Segerstedt.